Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21900J3QP38 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21900J3QP38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21900J3QP38 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21900J3QP38 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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