Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm19965J3QNY8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm19965J3QNY8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm19965J3QNY8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms