Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Cldn34c2J3QNM1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c2J3QNM1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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