Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20873J3QMQ9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20873J3QMQ9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms