Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calhm3J3QMI4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Calhm3J3QMI4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms