Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem200cJ3QK46 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem200cJ3QK46 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms