Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cldn34c3J3QJW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms