Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm17535J3KMR8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17535J3KMR8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms