Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20828J3KMI7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms