Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf148G3X9R7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms