Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp9yF8VPU6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Usp9yF8VPU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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