Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm28048F7BCN0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm28048F7BCN0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28048F7BCN0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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