Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Gm10378F6XQQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10378F6XQQ1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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