Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
ApobE9Q414 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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