Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt78E9Q0F0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt78E9Q0F0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms