Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc144bE9PVZ3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms