Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc175E9PVB3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms