Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx8D3YU81 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx8D3YU81 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx8D3YU81 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfx8D3YU81 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rfx8D3YU81 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rfx8D3YU81 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfx8D3YU81 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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