Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Abcc8B2RUS7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Abcc8B2RUS7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms