Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol7aB2RT54 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol7aB2RT54 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms