Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nfx1B1AY10 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms