Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M5A7VMS3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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H2-M5A7VMS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-M5A7VMS3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M5A7VMS3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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