Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plcb2A3KGF7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plcb2A3KGF7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms