Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Rtf1A2AQ19 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rtf1A2AQ19 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rtf1A2AQ19 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms