Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lcn6A2AJB9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lcn6A2AJB9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lcn6A2AJB9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lcn6A2AJB9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms