Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Prdm16A2A935 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms