Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbf1A2A870 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms