Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms