Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Knop1Q9Z2Q2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Knop1Q9Z2Q2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms