Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr1Q9Z2C4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms