Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx1Q9WV80 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms