Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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TapbpQ9R233 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TapbpQ9R233 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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TapbpQ9R233 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TapbpQ9R233 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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