Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ercc4Q9QZD4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ercc4Q9QZD4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms