Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx4Q9QY61 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms