Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms