Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Limd1Q9QXD8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms