Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkap1Q9JMB0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkap1Q9JMB0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms