Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Tmod4Q9JLH8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmod4Q9JLH8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms