Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CubnQ9JLB4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
CubnQ9JLB4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms