Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rfx5Q9JL61 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rfx5Q9JL61 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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