Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms