Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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