Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpf2Q9JJ80 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms