Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smad9Q9JIW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms