Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
OtofQ9ESF1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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