Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParvbQ9ES46 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ParvbQ9ES46 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms