Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trhr2Q9ERT2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms