Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms