Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms