Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sgf29Q9DA08 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms